MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN chromosome

Total Repeats: 16299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007292	CATT	2	8	12	19	25 %	50 %	0 %	25 %	71891794
2	NC_007292	TTG	3	9	29	37	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
3	NC_007292	GAG	2	6	38	43	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891794
4	NC_007292	AGC	2	6	60	65	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71891794
5	NC_007292	ATA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
6	NC_007292	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71891794
7	NC_007292	GAAA	2	8	180	187	75 %	0 %	25 %	0 %	71891794
8	NC_007292	ATCA	2	8	224	231	50 %	25 %	0 %	25 %	71891794
9	NC_007292	TAG	2	6	255	260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
10	NC_007292	GCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891794
11	NC_007292	GTA	2	6	326	331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
12	NC_007292	TTG	2	6	352	357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
13	NC_007292	AGA	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
14	NC_007292	TAGT	2	8	386	393	25 %	50 %	25 %	0 %	71891794
15	NC_007292	TTG	2	6	404	409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
16	NC_007292	TGT	2	6	453	458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891794
17	NC_007292	AAT	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
18	NC_007292	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891794
19	NC_007292	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
20	NC_007292	TAA	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
21	NC_007292	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
22	NC_007292	AGA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
23	NC_007292	TCA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
24	NC_007292	T	7	7	890	896	0 %	100 %	0 %	0 %	71891794
25	NC_007292	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71891794
26	NC_007292	CTA	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
27	NC_007292	CAAATG	2	12	967	978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71891794
28	NC_007292	T	7	7	1044	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	71891794
29	NC_007292	AG	3	6	1077	1082	50 %	0 %	50 %	0 %	71891794
30	NC_007292	ATT	2	6	1087	1092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891794
31	NC_007292	ATT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891794
32	NC_007292	T	7	7	1102	1108	0 %	100 %	0 %	0 %	71891794
33	NC_007292	TAC	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
34	NC_007292	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
35	NC_007292	ATT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891794
36	NC_007292	AAG	2	6	1199	1204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
37	NC_007292	AGA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
38	NC_007292	GAT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891794
39	NC_007292	AGA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
40	NC_007292	GTCT	2	8	1313	1320	0 %	50 %	25 %	25 %	71891794
41	NC_007292	CG	3	6	1359	1364	0 %	0 %	50 %	50 %	71891794
42	NC_007292	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	71891794
43	NC_007292	AAT	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
44	NC_007292	ATTA	2	8	1558	1565	50 %	50 %	0 %	0 %	71891794
45	NC_007292	AAATA	2	10	1640	1649	80 %	20 %	0 %	0 %	71891794
46	NC_007292	TCA	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891794
47	NC_007292	AAG	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891794
48	NC_007292	AGG	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891794
49	NC_007292	AAT	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
50	NC_007292	TTGGT	2	10	1852	1861	0 %	60 %	40 %	0 %	71891794
51	NC_007292	A	7	7	1863	1869	100 %	0 %	0 %	0 %	71891794
52	NC_007292	ATA	2	6	1886	1891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891794
53	NC_007292	AT	3	6	2646	2651	50 %	50 %	0 %	0 %	71891795
54	NC_007292	CAT	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
55	NC_007292	ATC	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
56	NC_007292	CTT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71891795
57	NC_007292	T	7	7	2752	2758	0 %	100 %	0 %	0 %	71891795
58	NC_007292	ATT	2	6	2763	2768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
59	NC_007292	TTTATT	2	12	2775	2786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891795
60	NC_007292	T	7	7	2948	2954	0 %	100 %	0 %	0 %	71891795
61	NC_007292	ATTT	2	8	2969	2976	25 %	75 %	0 %	0 %	71891795
62	NC_007292	ATTT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	71891795
63	NC_007292	CTT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71891795
64	NC_007292	TAC	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
65	NC_007292	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
66	NC_007292	ATC	2	6	3149	3154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
67	NC_007292	ATC	2	6	3161	3166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891795
68	NC_007292	TAT	2	6	3189	3194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
69	NC_007292	GTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891795
70	NC_007292	ATT	2	6	3240	3245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
71	NC_007292	TTA	2	6	3292	3297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891795
72	NC_007292	TGG	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71891795
73	NC_007292	TTACA	2	10	3356	3365	40 %	40 %	0 %	20 %	71891795
74	NC_007292	TTTTAT	2	12	3369	3380	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71891795
75	NC_007292	ATTT	2	8	3394	3401	25 %	75 %	0 %	0 %	71891795
76	NC_007292	TTA	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891796
77	NC_007292	TA	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	71891796
78	NC_007292	TGC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891796
79	NC_007292	AAT	2	6	3507	3512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891796
80	NC_007292	AGC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71891796
81	NC_007292	GTA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891796
82	NC_007292	T	6	6	3622	3627	0 %	100 %	0 %	0 %	71891796
83	NC_007292	CAA	2	6	3778	3783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71891797
84	NC_007292	TTTGT	2	10	3804	3813	0 %	80 %	20 %	0 %	71891797
85	NC_007292	TG	3	6	3836	3841	0 %	50 %	50 %	0 %	71891797
86	NC_007292	TAT	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891797
87	NC_007292	GCTTT	2	10	3945	3954	0 %	60 %	20 %	20 %	71891797
88	NC_007292	AAAT	2	8	4001	4008	75 %	25 %	0 %	0 %	71891797
89	NC_007292	TAAT	2	8	4021	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	71891797
90	NC_007292	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891797
91	NC_007292	GAAA	2	8	4098	4105	75 %	0 %	25 %	0 %	71891797
92	NC_007292	AAATG	2	10	4184	4193	60 %	20 %	20 %	0 %	71891797
93	NC_007292	ATA	2	6	4213	4218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891797
94	NC_007292	TTA	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891797
95	NC_007292	CGTA	2	8	4272	4279	25 %	25 %	25 %	25 %	71891798
96	NC_007292	ATTT	2	8	4345	4352	25 %	75 %	0 %	0 %	71891798
97	NC_007292	T	6	6	4389	4394	0 %	100 %	0 %	0 %	71891798
98	NC_007292	AT	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	71891798
99	NC_007292	TAT	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891798
100	NC_007292	AAT	2	6	4506	4511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891798
101	NC_007292	TAT	3	9	4516	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891798
102	NC_007292	TTAT	2	8	4550	4557	25 %	75 %	0 %	0 %	71891798
103	NC_007292	TA	3	6	4562	4567	50 %	50 %	0 %	0 %	71891798
104	NC_007292	TAGAAA	2	12	4579	4590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71891798
105	NC_007292	A	7	7	4626	4632	100 %	0 %	0 %	0 %	71891798
106	NC_007292	AT	3	6	4696	4701	50 %	50 %	0 %	0 %	71891798
107	NC_007292	ATT	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891798
108	NC_007292	TGAT	2	8	4735	4742	25 %	50 %	25 %	0 %	71891798
109	NC_007292	TAC	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891798
110	NC_007292	ATTA	2	8	4860	4867	50 %	50 %	0 %	0 %	71891799
111	NC_007292	CTG	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891799
112	NC_007292	ATCAG	2	10	4998	5007	40 %	20 %	20 %	20 %	71891799
113	NC_007292	TGG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71891799
114	NC_007292	AT	3	6	5108	5113	50 %	50 %	0 %	0 %	71891799
115	NC_007292	GTT	2	6	5136	5141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891799
116	NC_007292	AGT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891799
117	NC_007292	ATA	2	6	5177	5182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71891799
118	NC_007292	AGTC	2	8	5282	5289	25 %	25 %	25 %	25 %	71891799
119	NC_007292	AATT	2	8	5324	5331	50 %	50 %	0 %	0 %	71891799
120	NC_007292	TAT	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891799
121	NC_007292	CAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71891799
122	NC_007292	TGT	2	6	5451	5456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891799
123	NC_007292	A	7	7	5457	5463	100 %	0 %	0 %	0 %	71891799
124	NC_007292	AGA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891799
125	NC_007292	ATG	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71891799
126	NC_007292	TAC	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71891799
127	NC_007292	TCC	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71891799
128	NC_007292	AT	3	6	5696	5701	50 %	50 %	0 %	0 %	71891799
129	NC_007292	TTTA	2	8	5702	5709	25 %	75 %	0 %	0 %	71891799
130	NC_007292	GAA	2	6	5786	5791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71891799
131	NC_007292	TTG	2	6	5816	5821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71891799
132	NC_007292	TTC	2	6	5841	5846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71891799
133	NC_007292	T	7	7	5888	5894	0 %	100 %	0 %	0 %	71891799
134	NC_007292	ATTT	2	8	5903	5910	25 %	75 %	0 %	0 %	71891799
135	NC_007292	GGA	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71891799
136	NC_007292	TAT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71891799
137	NC_007292	GCT	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71891799
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139	NC_007292	GCA	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71891799
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